🎖 BIOINFORMATICA: El Futuro es Hoy

Mi idea con esta publicación, es acercar a las personas de todos los ámbitos al mundo de la Bioinformática y explicar por qué es tan importante para los investigadores el amplio rango de aplicaciones que ofrece esta rama de conocimiento.

Si eres un estudiante de Biologia, Medicina, Bioquimica o Informatica, nunca dejes pasar este tipo de oportunidades cuando se trata de tomar algún seminario, curso intensivo sobre Bioinformatica, porque créeme que te hará mucha diferencia del resto de tus competidores que siguen pensando en repetir procedimientos que se inventaron en siglos pasados. Y además, ya mucha ventaja nos llevan los norteamericanos, los europeos y ni que decir de los asiáticos al implementar en sus principales centros de Investigacion la Bioinformatica. Ahora es nuestro turno. Afortunadamente en Latinoamérica ya se ejerce esta disciplina como una carrera potencial, incluso ya existen facultades por lo que estudiar, es más accesible debido a toda la información disponible en la web.

Antes de comenzar, tengo que dejar en claro que yo no soy investigador, pero me estoy moldeando para ello, por tanto  me gustaría introducir desde mi punto de vista la bioinformática para todos. Yo empecé esta disciplina con una simple coincidencia navegando por internet, cuando trataba de comprender un proceso metabólico del organismo humano, di por casualidad con un video que me llamo la atención: “Bioinformatica: modelamiento molecular”.

Realmente quedé fascinado. Me sentí como Colon descubriendo América pero a la vez con un terror tremendo pues mis conocimientos en informática eran en ese entonces muy escasos, y claro todo lo relacionado con informática debe tener números y complicadas operaciones que nunca te saldrán porque te equivocaste en una coma o signo. Pero sin embargo, y para gran sorpresa mia, no fue así..

ES LA PREGUNTA LA QUE NOS IMPULSA

En momentos como esos tienes la mirada de un hombre que acepta lo que ve, porque estás esperando despertar y como la pregunta es siempre la que nos impulsa, busqué información previa sobre que es en sí la bioinformática y según la gran amiga [Wikipedia], la bioinformática: “es la aplicación de tecnología de ordenadores a la gestión y análisis de datos biológicos”, desde mi punto de vista, esta definición es un poco engañosa, porque la verdad es mucho más profunda, pero recalca muy bien en lo que es la definición básica.
Aun así, ¿qué quiere decir con la tecnología de ordenadores? yo en un principio pensé, “vea, ya estamos en la tecnología de los ordenadores, ¡¡maldita sea!!, ¡estoy en Matrix y Morfeo me ha ofrecido la ‘’pastillita’’ roja!, o sí, pero acepte la azul, no me acuerdo …”. Más tarde recapacite y deje de pensar en tonterías y busqué qué significado tiene y en este caso, se refiere a que con una serie de herramientas han conseguido que se puedan gestionar datos biológicos.

Bienvenido al mundo real: La Bio-info.

El éxito que ha tenido esta disciplina es que todos los investigadores del mundo puedan conocer la actualidad de las investigaciones que se están llevando a cabo, como los avances en la detección y tratamiento de enfermedades y la producción de alimentos genéticamente modificados, la Medicina Personalizada llamada también como medicina de precisión y Farmacogenetica.

De este modo, por ejemplo, un médico, bioquímico y biólogo puede conocer los estudios y avances sobre la ‘diabetes Mellitus tipo 1 en adolescentes’  o conocer la estructura o la secuencia  de una enzima antes de trabajar con ella.
Un aspecto importante es que todas las bases de datos de esta disciplina están sincronizadas, por lo que la actualización en una de ellas afecta a todas las bases. Es muy bueno porque no necesito estar dentro de todas las bases para actualizarme en donde me interesa sino que puedo leer el artículo relacionado de la proteína en una base de datos y pasar automáticamente a otra que me refleja su estructura tridimensional.

Son tres las subdiciplinas principales
a) El desarrollo de nuevos algoritmos (fórmulas matemáticas) y estadísticas para establecer relaciones entre miembros de grandes grupos de datos. Como dije anteriormente, mi gran miedo era el realizar formulas o algoritmos, pero hay que recorrer esa milla extra y solo lo logras cuando tomas acción.
b) El análisis y al interpretación de varios tipos de datos incluyendo secuencias de nucleótidos y aminoácidos, dominios proteicos y estructuras de proteínas. (Ejerciendo actualmente).
c) El desarrollo y la implementación de herramientas que permitan el acceso y manejo eficientes de diferentes tipos de información. (Aquí están los programadores y creadores de esas tremendas bases de datos como la NCBI, EMBL y la DDBJ)

La expansión de esta disciplina es muy reciente puesto que comenzó a emplearse años después de la revolución genómica tras conocer la secuenciación de Haemophilus influenzae (una bacteria que se puede infectar sin hacer nada hasta que un cambio por culpa de otro factor hace que esta bacteria sea peligrosa produciendo problemas respiratorios) en 1995, y desde entonces los genomas están siendo secuenciados a un ritmo rápido.

En octubre de 2011, según Wikipedia, las secuencias completas están disponibles para: 2.719 virus, 1115 archaea y bacterias , y 36 eucariotas , de los cuales aproximadamente la mitad son hongos . Por supuesto, hay que tener en cuenta que la bioinformática no avanzó únicamente por la secuenciación genómica.
El único Handicap de esta disciplina, es el idioma, donde todo lo descubierto y publicado en las bases de datos, están en inglés. Pero sin embargo lo bueno de esto es que el inglés se internacionaliza, es decir, de este modo  lo que  descubran los chinos no va han a publicar sus articulos en Mandarín y lo que  descubran los rusos no aparezca en eslavo.
De este modo el inglés es el idioma internacional donde todos los investigadores nos entendemos, y me ahorro tiempo aprender chino o eslavo si me interesa seguir el trabajo que llevan a cabo es esos países.

A mí me ha ayudado mucho hasta el momento ha realizar trabajos del ámbito médico (catedra de Fisiopatología, Genética (secuencias nucleotidicas de organismos), Inmunologico (estructuras de proteínas: MHC, interaccion Ag-Ac), como ha podido ser la National  Center Biotechnology Information (NCBI) y el European Bioinformatics institute (EMBL-EBI) y la búsqueda de proteínas para conocer su secuencia de aminoácidos para su análisis (UniProt  o Expasy) o tan solo una base de datos que nos hable de todo lo trabajado con la enzima (Brenda).

La Bioinformática no se resume solamente en bases de datos en Internet, también hay una gama de programas de por ejemplo, reproducir la estructura de una proteína (Jmol) u obtener los parámetros cinéticos de una enzima (WES).

CONCLUSIONES FINALES

Y este es solo un pequeño recorrido del casi ilimitado camino de la Bioinformática. No vine a decirles cómo va a acabar esto, vine a decirles que ya empezó y que te actualizes y tú mismo decidas si hacer mas de los mismo o reinvertarte a ti mismo. Ahora mismo te darás cuenta de que es distinto ver el camino que recorrerlo. Por si no te estás dando cuenta estoy intentando liberar tu mente. Pero sólo te puedo mostrar la puerta. Tú tienes que atravesarla. Como en un principio, si tomas la pastilla azul la historia se acaba, despierta en tu mundo y puedes ser lo que tú quieras ser. Si tomaste la roja te quedas en el País de las Maravillas que ya te lo enseñe en un pantallazo general.

El optar por un camino diferente no solo significa que hagas algo distinto, si no que implica tratar de modificar algo ya establecido, desafiar el status quo. Se lo que te toca elegir, muy pronto estarás en ese dilema de si trabajar para alguien u optar por algo diferente. Mi consejo es el siguiente: date una oportunidad en aprender más de lo que sabes, atrévete a descubrir nuevas disciplinas y combínalo con lo que ya sabes, así tendrás un repertorio más grande de opciones que muy probablemente te hará una diferencia abismal con el resto. Si no llevas esta disciplina, se el pionero en esto y aplícalos en todas las asignaturas. Recuerda que los pioneros siempre fueron criticados pero siempre tuvieron las mejores tierras y mejores resultados. Deja que la tecnología sea tu más grande y poderosa aliada.

Edwin W.